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生物信息學(xué)（序列搜尋比對分析）
計算為整數(shù)計算，基本無浮點計算； 計算的主要特點為頻繁的load 和write（內(nèi)存的讀寫），意味著需要較大的內(nèi)存容量和內(nèi)存帶寬， 需要直連架構(gòu)CPU；網(wǎng)絡(luò)的壓力不大，用最高性價比的千兆網(wǎng)，而不需求使用具有較高價格的Infiniband高速網(wǎng)。
分子動力學(xué)
主要是浮點計算為主 ，非常適合大規(guī)模并行，但是對網(wǎng)絡(luò)需求比較大，節(jié)點間需要使用低延時，高帶寬的Infiniband高速網(wǎng)。
分子對接（藥物設(shè)計）
計算量非常大，消耗計算機(jī)時很多；網(wǎng)絡(luò)的性能要求不高，擴(kuò)展性主要看看配體小分子的數(shù)量和它們計算規(guī)模的均勻性。
測序儀離線處理
相比計算量，存儲容量需求更大；作業(yè)運(yùn)行需要與作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)結(jié)合； 測序離線處理往往有序列拼接的需求,目前最主流的序列拼接軟件denovo為多線程程序,單節(jié)點內(nèi)存容量需求非常大,往往需要達(dá)到256G甚至512GB,需要配置大容量內(nèi)存SMP胖節(jié)點。
電子顯微鏡圖象處理
主要為浮點計算,其中大量的單精度FFT計算；軟件加速比完全線性,對網(wǎng)絡(luò)依賴低； 軟件內(nèi)存需求和IO需求較大,一般需要配置并行文件系統(tǒng)； 系統(tǒng)計算量大，計算時間長，系統(tǒng)穩(wěn)定性，可靠性要求高。
質(zhì)譜儀原始資料處理
軟件加速比接近線性,對網(wǎng)絡(luò)依賴低；系統(tǒng)計算量大，計算時間長，系統(tǒng)穩(wěn)定性，可靠性要求高。
寶德生命科學(xué)高性能計算集群是一個有機(jī)的、高性能、高可靠性的集群系統(tǒng)。系統(tǒng)的硬件都選用經(jīng)過嚴(yán)格測試的主流產(chǎn)品，保證系統(tǒng)的可靠性；互聯(lián)系統(tǒng)各組件的網(wǎng)絡(luò)都是專用的高效網(wǎng)，通過集群核心的管理系統(tǒng)使得整個系統(tǒng)協(xié)調(diào)一致的運(yùn)行，如單獨的一臺高性能計算機(jī)一樣為用戶提供統(tǒng)一的服務(wù)。
該集群向用戶提供一個單一計算機(jī)的界面。前置計算機(jī)負(fù)責(zé)與用戶交互，并在接受用戶提交的計算任務(wù)后通過調(diào)度器程序?qū)⑷蝿?wù)分配給各個計算節(jié)點執(zhí)行；運(yùn)行結(jié)束后通過前置計算機(jī)將結(jié)果返回給用戶。程序運(yùn)行過程中的進(jìn)程間通信通過專用網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行。
? 方案計算系統(tǒng)的選擇實現(xiàn)了多樣化，該方案配置10個寶德自研的雙路八核刀片服務(wù)器PR8020P。刀片式集群系統(tǒng)在計算密度、功耗散熱、運(yùn)營成本、維護(hù)成本、可靠性等方面，都明顯優(yōu)于其它系統(tǒng)，且為系統(tǒng)的擴(kuò)容升級提供了良好的基礎(chǔ)。
? 計算系統(tǒng)也可采用寶德高性能PR2510P雙路服務(wù)器，注重浮點峰值和內(nèi)存性能。對于大內(nèi)存的需求，采用寶德自研八路PR8800G SMP服務(wù)器，采用了因特爾至強(qiáng)E7 v4處理器。
? 互聯(lián)系統(tǒng)各組件的網(wǎng)絡(luò)都是專用的高效網(wǎng)絡(luò)，通過集群核心的管理系統(tǒng)使得整個系統(tǒng)協(xié)調(diào)一致的運(yùn)行。
能為苛刻的生命科學(xué)計算提供高浮點運(yùn)算性能，計算集群可靈活采用多種計算系統(tǒng)
計算網(wǎng)絡(luò)采用高速的EDR 100Gb IB網(wǎng)絡(luò)互聯(lián)，確保用戶的計算任務(wù)在運(yùn)行過程中不受網(wǎng)絡(luò)帶寬的限制，延遲低速度快。兩層高速網(wǎng)絡(luò)保障集群中所有節(jié)點無阻塞、全線速的運(yùn)行，可充分滿足高速互聯(lián)的需求。
主要產(chǎn)品都采用了冗余設(shè)計（電源、風(fēng)扇等），存儲系統(tǒng)采用雙鏈路冗余設(shè)計，系統(tǒng)的可靠性有較高保證
GPU節(jié)點、存儲節(jié)點、計算節(jié)點等有很高的擴(kuò)展性，既能滿足現(xiàn)階段的業(yè)務(wù)要求，也能更具未來業(yè)務(wù)量的增長進(jìn)行升級和擴(kuò)容。
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