高通量測序，也叫“下一代測序”，最新的是三代測序，是一種快速測定大量DNA序列的技術(shù)，主要應(yīng)用于DNA測序、RNA測序、表觀遺傳學(xué)等基因組測序及轉(zhuǎn)錄測序等，它有力地推動生物科學(xué)研究的發(fā)展，也與人類的生活與健康息息相關(guān)，在微生物與人體健康系統(tǒng)的生態(tài)平衡、新生兒疾病篩查、腫瘤的診斷與治療、遺傳病和耐藥性檢測等領(lǐng)域都有廣泛的臨床應(yīng)用。
近日，寶德為世紀(jì)壇醫(yī)院升級打造的高性能計算集群系統(tǒng)，提供了堅實可靠的計算和存儲底座，助力醫(yī)院高通量測序更加快速精準(zhǔn)，為加速醫(yī)院臨床科研和成果轉(zhuǎn)化奠定良好的基礎(chǔ)。
首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京世紀(jì)壇醫(yī)院（文中簡稱“世紀(jì)壇醫(yī)院”）是集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防和保健為一體的三級甲等綜合醫(yī)院，擁有高水平的醫(yī)療專家人才隊伍，先進(jìn)的醫(yī)療技術(shù)和設(shè)備、以及非常優(yōu)秀的醫(yī)療水平，多次承擔(dān)國際醫(yī)療援助、精準(zhǔn)扶貧與國內(nèi)對口援助、大型醫(yī)療保障任務(wù)。同時，醫(yī)院堅持科研教學(xué)齊頭并進(jìn)，不斷加強(qiáng)在醫(yī)學(xué)創(chuàng)新和科研項目的投入，并且加強(qiáng)國際合作，全力打造示范新型的現(xiàn)代臨床研究體系。世紀(jì)壇醫(yī)院原有IT系統(tǒng)的服務(wù)對象非常廣泛，既是各實驗室、各學(xué)科方向的科研支撐平臺，也是基因測序的核心計算和數(shù)據(jù)匯聚平臺，所以用戶數(shù)量很大而且離散度高、應(yīng)用軟件種類多而雜。隨著科研業(yè)務(wù)發(fā)展和數(shù)據(jù)量的暴增，原系統(tǒng)在應(yīng)對計算密集、網(wǎng)絡(luò)密集、IO密集、耦合密集型等不同硬件需求，以及高并發(fā)、快速實時響應(yīng)等要求面前開始顯得無力，強(qiáng)穩(wěn)定性、高擴(kuò)展性和高度自動化運(yùn)維的新型高性能計算集群呼之欲出。基于客戶實際需求的深入調(diào)研，考慮到新系統(tǒng)主要是為承擔(dān)實驗后期的高通量測序任務(wù)，同時要存儲測序后產(chǎn)生的日益增多的基因組數(shù)據(jù)，寶德為世紀(jì)壇醫(yī)院升級打造了高性能集群系統(tǒng)，該系統(tǒng)集合寶德高密度四子星計算服務(wù)器PR2720TW、寶德大內(nèi)存計算服務(wù)器PR4865P、寶德分布式并行存儲PLStor、圖形工作站PT6630W、寶德交換機(jī)及寶德集群管理軟件于一體，整體可提供416個CPU計算核心、內(nèi)存總量6.75TB、Tflops 峰值達(dá)29.08萬億次、并行存儲裸容量1050TB的計算和存儲算力；同時，系統(tǒng)采用100GB IB網(wǎng)絡(luò)，可以有效保障大模型大數(shù)據(jù)集的需求，并利用現(xiàn)有采用管理網(wǎng)絡(luò)，連接所有節(jié)點。此外，新系統(tǒng)配置的寶德集群管理套件，能提供集群的管理、監(jiān)控、資源調(diào)度等使用接口和管理接口界面，非常方便客戶的日常運(yùn)維，幫助客戶高效利用集群計算和存儲資源，并且有效降低成本。客戶表示，寶德高性能計算集群的硬件系統(tǒng)包含了登錄/管理節(jié)點、高密度計算節(jié)點、大內(nèi)存節(jié)點、分布式并行存儲、千兆管理網(wǎng)絡(luò)、萬兆網(wǎng)絡(luò)等硬件設(shè)備，軟件系統(tǒng)包含了集群基礎(chǔ)環(huán)境軟件、集群系統(tǒng)管理軟件、分布式并行存儲系統(tǒng)軟件、生信分析軟件及流程中間件軟件等，二者合力能為醫(yī)院的高通量測序保駕護(hù)航。而且，在硬件系統(tǒng)上架安裝、布線、加電、確保與現(xiàn)有設(shè)備的有效連接，軟件集成的安裝和實施，應(yīng)用系統(tǒng)的集成和系統(tǒng)優(yōu)化、測試和多維度的項目培訓(xùn)……在整個項目的交付和實施、測試過程中，寶德團(tuán)隊表現(xiàn)了高度專業(yè)性和責(zé)任心，既滿足了醫(yī)院科研支撐平臺先進(jìn)高效、穩(wěn)定可靠的算力要求，又給科研工作和日常運(yùn)維帶來了超出預(yù)期的增值服務(wù)體驗。科技的終極目標(biāo)是服務(wù)于人類，高通量測序技術(shù)關(guān)系到人類基因和生命密碼。國家發(fā)改委《“十四五”生物經(jīng)濟(jì)發(fā)展規(guī)劃》提出，要加快發(fā)展高通量基因測序技術(shù)，推動以單分子測序為標(biāo)志的新一代測序技術(shù)創(chuàng)新，不斷提高基因測序效率、降低測序成本。寶德將繼續(xù)發(fā)揮自身在信息科技領(lǐng)域的技術(shù)優(yōu)勢，攜手廣大合作伙伴，以更加先進(jìn)的軟硬件產(chǎn)品方案和全棧服務(wù)為包括世紀(jì)壇醫(yī)院等在內(nèi)的更廣泛醫(yī)療衛(wèi)生行業(yè)客戶提供堅實的算力底座，助力中國醫(yī)療科技和醫(yī)學(xué)科研行穩(wěn)致遠(yuǎn)！
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