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應(yīng)用案例

經(jīng)過20多年的發(fā)展,寶德持續(xù)而深刻地把握市場需求,積累了海量的客戶資源和豐富的服務(wù)經(jīng)驗

寶德助地壇醫(yī)院抗擊埃博拉
案例背景

日前,寶德在首都醫(yī)科大學附屬醫(yī)院北京地壇醫(yī)院(簡稱“地壇醫(yī)院”)埃博拉出血熱病例應(yīng)急設(shè)備采購項目中一舉中標,為客戶量身定做的包括硬件建設(shè)、系統(tǒng)建設(shè)、軟件建設(shè)與技術(shù)服務(wù)在內(nèi)的HPC集群解決方案,為地壇醫(yī)院在埃博拉病毒檢測以及后期病原檢測方面的研究提供了高計算能力、高性能、高存儲的計算平臺,加快了地壇醫(yī)院提升埃博拉病毒檢測、病原檢測等生命科學科研水平的步伐。

案例分析

地壇醫(yī)院始建于1946年,是北京市衛(wèi)生局直屬三級甲等醫(yī)院,也是北京大學醫(yī)學部、北京中醫(yī)藥大學教學醫(yī)院。國家肝病、艾滋病臨床藥物驗證基地、國家中醫(yī)藥管理局中西醫(yī)結(jié)合傳染病臨床基地均設(shè)于此。醫(yī)院主要承擔除結(jié)核病以外的39種法定傳染病的診治、研究和培訓任務(wù),是一家集醫(yī)療、教學、科研、預(yù)防為一體的公共衛(wèi)生臨床醫(yī)療機構(gòu)。2014年8月埃博拉病毒肆虐非洲,疫情瞬息萬變。地壇醫(yī)院第一批援幾內(nèi)亞醫(yī)療隊于8 月12日兩小時內(nèi)集結(jié)完畢趕赴西非。針對可能發(fā)生的埃博拉出血熱疫情傳入風險,北京市衛(wèi)生計生委指定地壇醫(yī)院為埃博拉出血熱定點收治醫(yī)院。中國雖然沒有發(fā)現(xiàn)埃博拉病毒患者,但是疑似患者入院治療的情況還是屢有發(fā)生。為防止埃博拉病毒入侵我國,地壇醫(yī)院啟動了埃博拉出血熱病例應(yīng)急設(shè)備的采購。通過對客戶背景與應(yīng)用需求的深入分析,結(jié)合以往在生物信息與生命科學領(lǐng)域HPC方面的成功案例,寶德最終為客戶確定了基于寶德生物一體機PowerScale8000-B高性能計算機集群系統(tǒng)的解決方案。寶德PowerScale8000-B是一套應(yīng)用于生物信息計算的一體機,能為客戶在序列比對、序列拼接、GPU 加速方面提供更的高性能保證;它使用目前業(yè)界先進的軟件定義存儲,在安全、性能、管理方面能發(fā)揮極致性能。

解決方案

寶德PowerScale8000-B高性能計算機集群系統(tǒng)
寶德PowerScale8000-B高性能計算機集群系統(tǒng)作為埃博拉病毒檢測以及地壇醫(yī)院后期病原檢測的主要計算單元,配合高通量測序儀一起完成地壇醫(yī)院埃博拉病毒應(yīng)急設(shè)備項目,每次要滿足測序儀>150億(15G)堿基數(shù)據(jù)的計算,并且每次對>2000 萬個片段序列的數(shù)據(jù)的分析,要滿足98%以上的原始數(shù)據(jù)的準確性。為此,寶德為客戶設(shè)計了一套擁有10.49萬億次計算能力的HPC集群整體解決方案。該方案網(wǎng)絡(luò)部分采用雙網(wǎng)分離結(jié)構(gòu),包括管理網(wǎng)和計算網(wǎng)兩部分,管理網(wǎng)使用一臺千兆交換機實現(xiàn)對所有節(jié)點的正常管理;計算網(wǎng)使用超低延遲核心萬兆以太網(wǎng)交換機作為數(shù)據(jù)傳輸通路,保證數(shù)據(jù)的無阻塞、高效快速轉(zhuǎn)發(fā),以便更快地計算出數(shù)據(jù)結(jié)果。存儲部分設(shè)計了一套分布式的海量存儲系統(tǒng),整套系統(tǒng)可提供70TB的可使用空間、800MByete/s的實際使用帶寬,以及60萬/s的IOPS 并發(fā)訪問數(shù),以保證數(shù)據(jù)調(diào)用的暢通無阻。事實上,此次與地壇醫(yī)院的合作只是寶德HPC解決方案在生命科學行業(yè)成功應(yīng)用的一個縮影,此前,寶德與華大基因、中國科學院北京生命科學院、中國疾病監(jiān)控中心、嘉寶仁和醫(yī)療有限公司等行業(yè)客戶在生命科學研究領(lǐng)域展開了全面合作,在該領(lǐng)域積累了大量的客戶與行業(yè)經(jīng)驗。其中,與華大基因的多次合作更是締造了寶德高性能服務(wù)器PowerScale繪制全球第一張“黃種人基因圖譜”、寶德Power Cluster8000HPC計算機系統(tǒng)繪制大熊貓基因兩座里程碑。

客戶收益

波士頓咨詢公司(BCG)發(fā)布的報告顯示,中國醫(yī)療科技市場將在2013 年至2020 期間保持14%的年均增長率,到2020 年,市場規(guī)模將增至550億美元,成為全球第二大醫(yī)療科技市場。報告預(yù)測,到2020年,中國醫(yī)療科技市場將超越日本和德國,從2013 年的世界第四位躍升至第二位,占據(jù)全球市場份額的13%。目前,國內(nèi)醫(yī)療科研市場HPC應(yīng)用正處于起步階段,許多國產(chǎn)服務(wù)器廠商在醫(yī)療科研市場表現(xiàn)乏力,醫(yī)療科研市場存在大范圍空白。長期以來,寶德一直致力于國內(nèi)HPC的應(yīng)用與普及,憑借在HPC領(lǐng)域的深入研究,寶德大力開拓醫(yī)療科研市場,在該領(lǐng)域積累了深厚的經(jīng)驗,填補了醫(yī)療科研市場HPC應(yīng)用的空白,并為加快我國醫(yī)療科研領(lǐng)域的研究成果落地轉(zhuǎn)化做出了突出的貢獻


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